混乱带来的非战斗损伤比直接战斗损伤还要严重，很多人死在了这场混乱中，帝国经济与科技也因此而倒退至少三十年。
史称“机械之乱”。
而苏笠被判以重罪，不只是因为他发现主脑产生自主意识后隐而不报，更因为在后来的混乱中，弥撒是在苏笠的帮助下逃出星系，在一颗遥远的星球建立起一个机械国度，与帝国对峙。
百年来，帝国多次试图摧毁这颗星球，但都没有成功，他们甚至还未靠近就已经被机械大军给包围住。帝国不知道这个由机械生命建立的国度，内部如今发展成什么样子，唯一值得庆幸的是，弥撒从未主动攻击过人类。
中央主脑瘫痪，意味着整个帝国甚至是全星际的瘫痪，所以帝国皇帝不得不赦免苏笠的死罪，给他判处五百徒刑，在重重监视之下，再次参与中央主脑的设计与修复工作。
作为一名不可能在有生之年刑满释放的囚徒，苏笠本来是不允许结婚生子的。然而，负责给他作定期心理及健康检查的医生爱上了他，并偷偷怀上了他的孩子。
为了养胎，更重要的是不被其他人发现顺利生下孩子，女医生独自躲到了一颗开满蔷薇花的星球。她与苏笠约定好，等孩子出生后，便会回到他身体，一家三口团聚。
然而，事与愿违。
异形女王突袭了这颗星球，女医生被找到时，只剩一半的身体，还有一只死去的异形。而她另一半血肉模糊的身体下，压着她刚产下的孩子。
没有人知道，她被异形发现时，是在生产之后，还是生产之中。
那个女医生，是当今帝国医院院长的妹妹，苏辰的，生身母亲。
得知妻子的死，苏笠用了些手段要回了妻子的残骸和自己的孩子——只要帝国舍不得杀死苏笠，他的脑袋就是最大的砝码，他的威胁，也总能有用。
或许是因为不足月离开母体，又或许是离开母体的方式属于非自然方式，那个孩子的身体一直不好。
苏笠为了让自己的孩子能活下去，尝试了不少手段，其中之一就是试图为那个孩子制造出一个身体。为此，他甚至开始做人体实验，被发现后立即禁止并销毁了一切资料。
六年后，那个孩子陷入彻底昏睡，被宣布脑死。
再过不久，苏笠带着自己的孩子，从帝国消失。
在脑海中与埃贝尔交流一阵，被科普了一下自己父亲的丰功伟绩，也完全清楚了自己的身世，苏辰一时感到有些茫然。
所以说，那位莫菲斯院长，其实是自己的舅舅？
“……贝贝，我现在的身体，是人类吗？”
“当然是啦，小辰辰的身体一直没有换过。因为博士说，这是妈妈留给小辰辰唯一的礼物，谁都不可以动，小辰辰要自自然然，健健康康地长大。”
“……妈妈。”一滴透明的眼泪，自眼角缓缓滑落。
那一滴眼泪，刺痛了重明的心，他用指腹轻轻擦掉苏辰眼角的泪水，凝望着他的眼睛与他对视片刻。之后转过头，望向站在后面，神情莫明的莫菲斯院长。
“莫菲斯院长，你只提他的父亲，为什么不提他的母亲？还是说，你将自己对苏笠博士的怨恨，转移到了一个孩子身上，哪怕他是你的，亲外甥？”
莫菲斯院长的脸色骤然大变，胸口如被重重击打一拳，踉跄后退，面色发白而神情仓皇。看到他这个样子，重明有些不忍，但为了替苏辰消除一切隐患，争取同盟，他只得继续逼迫莫菲斯正视苏辰的身份，正视他与自己的血缘关系。
“小辰是莉雅医生唯一的孩子，莉雅医生当年为了保护自己的孩子，以产后的虚弱身体，赤手空拳杀死一只异形。莫菲斯院长，对于莉雅医生所珍视的孩子，你真的忍心将他送上实验台，解剖他，研究他吗？”
“不要说了！你住口！当年如果不是苏笠引诱了莉雅，她根本就不会死。是苏笠害死了她！”莫菲斯院长突然暴发起来，此时他完全忘了重明是什么身份，也忘了帝国皇帝和自己站在同一个屋子里，愤怒地大喊起来。
重明没有反驳，只是用那种仿佛知道一切的目光望着他，沉默不语。
激动中的莫菲斯院长，慢慢地自己平复下来，他闭着眼吸了口气，向床上的苏辰深深看了一眼，霍然转身而去，没有再说一个字。
“说吧，把朕的首席院长气走了，打的什么主意？”一直保持沉默的重楼陛下，直到此时才闲闲地开口，没受之前紧张气氛的半点影响。
重明看了自家兄长一眼，身体放轻松不少，他握住床上少年的手，深吸一口气，平静地说了一句话，“小辰现在的情况，跟苏笠博士无关，而是跟异形有关。”
重楼霍然站起来，脱口道：“你说什么？”
“皇兄，小辰他，很可能知道了异形的巢穴在哪里。”
重明的话，让重楼彻底失声。
之前进入苏辰的意识空间，重明看到了许多苏辰意识深处的东西。其中有很多关于异形的信息，有些是他以前见过的，有些，则是他没有见过的。
在重楼离开后，重明住宅的安全等级，被提升到了帝国最高级，比皇帝居住的皇宫还要高，与中央主脑的核心终端等同。
重明轻抚着苏辰的脸，温柔地注视着他的眼睛，“别怕，我不会让你迷失的，我们好不容易能在现实世界里相逢，我怎么会让你再陷入那个黑暗冰冷的虚无世界。”